أكدت رئيسة مرصد شاهد علا بن نجمة أنه تم رصد عدة اخلالات خلال العملية من أبرزها اللجوء إلى الطريقة اليدوية في تسجيل الناخبين قائلة إنه تم تسجيل تأخر على المواعيد الانتخابية التي عرفتها تونس منذ 2011.
واعتبرت بن نجمة أن التسجيل الآلي الذي تم اعتماده لتسجيل الناخبين الجدد خطير جدا لافتة النظر إلى تضارب الأرقام التي نشرتها الهيئة بخصوص عدد المسجيلن للاستفتاء.
كما شددت بن نجمة أنه تم رصد عديد التجاوزات المتعلقة باستعمال الادارات العمومية كالبلديات ضمن حملة الاستفتاء مطالبة بحياد السلطة التنفيذية باعتبارها طرفا في الاستفتاء.